rckato, quando você faz um projeto dum circuito, tem que levar em conta várias aspectos:
- tem que funcionar
- tem que funcionar sempre
- tem que ser barato
- mesmo sendo barato, deve continuar funcionando
- precisa passar em testes de compatibilidade eletromagnética
Até o último ítem, isso é coisa normal do dia-a-dia. Daí quando vai fazer testes de compatibilidade... senta e chora.
A questão é que o resistor não é necessário para funcionar. Ele até atrapalha, se o seu valor não for bem casado com o cristal e o micro. Só que com ele, forma um filtro com o circuito em torno que tende as frequências harmônicas. Eu não sei direito o motivo (mas tem um bom motivo), mas frequências mais altas se propagam melhor, principalmente dentro da câmara anecóica de testes...
Os capacitores foram colocados ali não para inverter a ordem, mas para puxar o GND através daquele caminho, ligando ao pino de GND do micro por uma trilha exclusiva. Devido às trilhas de GPIO que saem dos pinos que ficam entre o OSC e o GND, essa ligação ou seriam impossível, ou cruzaria com sinais sensíveis. Daí o designer puxa pro primeiro GND que ele vê na redondeza, e isso pode causar problemas.